La disputa por la soberanía del río San Juan, que marca la frontera entre Costa Rica y Nicaragua, es el principal motivo de una batalla entre los gobiernos de ambos países, que aseguran estar dispuestos a imponer sus intereses a cualquier precio. El presidente de Costa Rica, Abel Pacheco, ha amenazado con acudir a la Corte Internacional de Justicia de la Haya (CIJ) si su país vecino impide que guardias costarricenses naveguen por el río. Nicaragua ha respondido que si esa petición sale adelante, aplicará un impuesto patriótico a la importación de productos de Costa Rica.

Este conflicto entre ambos países se produce justo en la fecha en que termina la tregua de tres años que los presidentes de Costa Rica y Nicaragua habían firmado en 2002. Un periodo en el que delegaciones de las dos naciones fronterizas discutirían los términos de soberanía del río después de que en 2001 el Gobierno nicaragüense bloquease el acceso a la zona de guardias costarricenses armados.

El ministro de Exteriores de Costa Rica, Roberto Tovar, reconoce que la soberanía del río es de Nicaragua, pero que su país tiene derecho a que se le respete la navegación de acuerdo con lo que establecen los diferentes acuerdos legales que ambos gobiernos firmaron.

Sin embargo, el Gobierno de Nicaragua asegura que los tratados asumidos por las dos naciones revelan que los nicaragüenses tienen exclusivamente el dominio del río desde su nacimiento hasta su llegada al Océano Atlántico y que Costa Rica tiene únicamente derecho de libre navegación con objeto de comcercio.

Por el momento, la Asamblea Legislativa de Nicaragua ha aprobado una resolución en la que indicá que se cobrará un impuesto del 35% a las importaciones costarricenses si el presidente de Costa Rica, Abel Pacheco, pide a una audiencia a la CIJ.